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微生物组学研究技能学习群
微生物组学技能培训系列课程
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序列处理: 23个
统计与绘图: 59个
表格处理: 8个
基因组与功能注释: 69个
比较分析: 10个
关系分析图: 6个
基因组可视化: 1个
基因组评估: 8个
数据下载: 4个
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单基因序列进化树构建(mafft+fasttree)
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比较分析
gbk文件转换为gff3文件
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数据与格式转换
耐药突变位点分析(PointFinder)
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基因组与功能注释
基于多序列比对文件生成SNP距离矩阵(snp-dists)
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比较分析
从gbk格式中提取基因组FastA序列
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计算序列GC含量
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基于FastA比对文件提取SNP位点(SNP_site)
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获得性抗菌素耐药基因、点突变、应激反应因子和毒力因子预测(AMRFinderPlus)
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植物生长促进性状(PGPT)注释—PGPg Finder
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基因组与功能注释
真菌群落(ITS)功能预测(FUNGuild)
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基因组与功能注释
宏基因组数据真核序列识别(Tiara)
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宏病毒组数据质量评估和前病毒检测
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基因组与功能注释
差异表达基因火山图
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环状热图绘制
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细菌基因组下载(基于GCA/GCF-单样品下载)
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FASTA文件批量合并
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多样性代表序列进化树构建
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批次效应处理(Batch_effects)
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金黄色葡萄球菌SCCmec元件识别
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基因组与功能注释