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微生物组学研究技能学习群
微生物组学技能培训系列课程
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数据与格式转换: 8个
序列处理: 33个
统计与绘图: 59个
表格处理: 8个
基因组与功能注释: 57个
比较分析: 4个
关系分析图: 3个
基因组可视化: 1个
基因组评估: 7个
数据下载: 3个
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细菌基因组下载(基于GCA/GCF)
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数据下载
单基因序列进化树构建(mafft+fasttree)
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序列处理
gbk文件转换为gff3文件
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数据与格式转换
耐药突变位点分析(PointFinder)
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基因组与功能注释
质粒片段识别(PLASMe)
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基因组与功能注释
基于多序列比对文件生成SNP距离矩阵(snp-dists)
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序列处理
从gbk格式中提取基因组FastA序列
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序列处理
计算序列GC含量
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统计与绘图
基于FastA比对文件提取SNP位点(SNP_site)
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FASTA文件批量合并
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序列处理
细菌完成图序列文件分割(多序列文件分割)
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序列处理
BLASTN核酸序列比对-Pro版
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序列处理
多样性代表序列进化树构建
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序列处理
批次效应处理(Batch_effects)
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统计与绘图
金黄色葡萄球菌SCCmec元件识别
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基因组与功能注释
多序列比对结果可视化(pyMSAviz)
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统计与绘图
质粒多位点序列分型(pMLST)
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基因组与功能注释
沙门氏菌血清分型(SeqSero2)
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基因组与功能注释
T3SS效应蛋白预测(EffectiveT3)
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基因组与功能注释
大肠埃希菌亚群分类和鉴定(ClermonTyping)
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基因组与功能注释
大肠杆菌血清分型、志贺毒素分型和病理分型(ECTyper)
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