MUSCLE多序列比对

MUSCLE （Multiple Sequence Comparison by Log-Expectation）是一款常用的多序列比对软件，可用于 DNA、RNA 和蛋白质序列的全局多序列比对。MUSCLE 具有较好的比对准确性和运行效率，适合处理中小规模序列集。
本工具基于 MUSCLE 开发，可用于基于提供的FASTA 格式序列文件自动执行多序列比对，并输出比对后的FASTA 文件。

示例文件：

将所有需比对的序列保存到同一fasta格式文件中进行序列比对，支持核酸或蛋白序列的比对（长度<10kb）

小工具结果：

   output.aligned.fasta：对齐后的序列，可用于进一步的进化树构建

软件版本：

   MUSCLE v3.8.1551 by Robert C. Edgar

参考文献：

Edgar RC. and Tolstoy I., Muscle-3D: scalable multiple protein structure alignment (2024) BioRxiv.

此版本是1.0，上架时间是20260820

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