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微生物组学研究技能学习群
微生物组学技能培训系列课程
全部小工具: 185个
数据与格式转换: 11个
序列处理: 24个
统计与绘图: 57个
表格处理: 8个
基因组与功能注释: 57个
比较分析: 10个
关系分析图: 6个
基因组可视化: 1个
基因组评估: 7个
数据下载: 4个
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细菌基因组下载(基于GCA/GCF-批量下载)
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单基因序列进化树构建(mafft+fasttree)
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gbk文件转换为gff3文件
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数据与格式转换
耐药突变位点分析(PointFinder)
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基因组与功能注释
微生物二代测序全自动化组装(SKESA软件)
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序列处理
质粒片段识别(PLASMe)
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基因组与功能注释
基于多序列比对文件生成SNP距离矩阵(snp-dists)
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比较分析
从gbk格式中提取基因组FastA序列
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序列处理
计算序列GC含量
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统计与绘图
基于FastA比对文件提取SNP位点(SNP_site)
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比较分析
MLST分析(批量注释)
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基因组与功能注释
环状热图绘制
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统计与绘图
细菌基因组下载(基于GCA/GCF-单次支持5个)
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微生物基因组COG分类注释(批量处理)
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基因组与功能注释
RGI 预测核酸/蛋白质序列注释(批量处理)
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基因组与功能注释
FASTA文件批量合并
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细菌完成图序列文件分割(多序列文件分割)
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序列处理
大肠埃希菌亚群分类和鉴定(ClermonTyping-批量处理)
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基因组与功能注释
金黄色葡萄球菌SCCmec元件识别(批量处理)
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基因组与功能注释
沙门氏菌血清分型(批量分型)
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基因组与功能注释
BLASTN核酸序列比对-Pro版
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