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微生物组学研究技能学习群
微生物组学技能培训系列课程
全部小工具: 199个
数据与格式转换: 11个
序列处理: 23个
统计与绘图: 59个
表格处理: 8个
基因组与功能注释: 69个
比较分析: 10个
关系分析图: 6个
基因组可视化: 1个
基因组评估: 8个
数据下载: 4个
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微生物毒力基因VFDB数据库注释-Pro版
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基因组与功能注释
单基因序列进化树构建(mafft+fasttree)
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比较分析
gbk文件转换为gff3文件
1671
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数据与格式转换
耐药突变位点分析(PointFinder)
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基因组与功能注释
质粒片段识别(PLASMe)
2262
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基因组与功能注释
基于多序列比对文件生成SNP距离矩阵(snp-dists)
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比较分析
从gbk格式中提取基因组FastA序列
1452
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序列处理
计算序列GC含量
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统计与绘图
基于FastA比对文件提取SNP位点(SNP_site)
1904
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比较分析
MLST分析(批量注释)
2112
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基因组与功能注释
质粒片段识别(PLASMe-批处理版)
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基因组与功能注释
获得性抗菌素耐药基因、点突变、应激反应因子和毒力因子预测(AMRFinderPlus)
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基因组与功能注释
肺炎克雷伯菌基因组数据分析(Kleborate)
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基因组与功能注释
真菌效应物预测(FunEffect)
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基因组与功能注释
WoLF PSORT 蛋白质亚细胞定位预测(animal/fungi/plant)
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基因组与功能注释
真菌和卵菌中的胞间质与细胞质效应因子预测(EffectorP 3.0 )
109
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基因组与功能注释
植物生长促进性状(PGPT)注释—PGPg Finder
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基因组与功能注释
生态相关微生物性状分析(EcoFoldDB)
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基因组与功能注释
真菌群落(ITS)功能预测(FUNGuild)
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基因组与功能注释
宏基因组数据真核序列识别(Tiara)
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基因组与功能注释
基于深度学习的基因注释工具(Helixer)
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