基于 BLASTP 的蛋白质序列相似性分析与基因簇可视化工具

本工具基于 R 语言与 GeneViewer 引擎开发的蛋白质同源比对与基因簇可视化工具，专为比较基因组学、次级代谢产物研究与功能注释设计。

只需上传标准 CSV 文件，指定目标基因簇，即可自动完成：

✅ 蛋白质序列 BLASTP 比对

✅ 同源基因簇识别

✅ 交互式基因结构图谱生成

✅ 结果表格与 HTML 可视化一键导出

🎯 核心功能

🔍 智能序列比对

• 支持 自定义 identity 阈值（30–100%）

• 内置并行计算，加速大规模蛋白比对

• 自动过滤低质量匹配，保留高可信同源结果

🧩 基因簇全景可视化

• 按 功能分类自动着色

• 显示基因方向、位置、名称

• 鼠标悬停查看完整注释信息

🔗 同源关系连线

• 清晰展示 BLASTP 同源基因对

• 连线粗细反映相似度高低

• 一眼识别保守基因簇结构

📊 双重结果输出

• 📄 CSV 表格：便于后续统计分析

• 🌐 HTML 交互图谱：适合汇报、展示与论文补充材料

protein_id：蛋白质唯一标识；translation：蛋白质氨基酸序列；product：蛋白功能描述；gene：基因名；cluster：基因簇名称，此列要求由字母，数字组成，禁止包含空格，用于指定查询 cluster 名称；strand：链方向（+/-）；start：起始位置；end：终止位置；Functions：基因功能分类

📤 输出结果

BlastP_results.csv：同源比对明细表

blastp_interactive_GC_links.html：可交互基因簇图谱

• 客服电话：
  15618809518
• 客服手机：
  15618809518（微信同号）
• 联系邮箱：
  marketing@winnerbio.cn
• 客服微信：
• 微信公众号：