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基于多序列比对文件生成SNP距离矩阵(snp-dists)

利用比对文件,计算两两序列之间的SNP,最终获得SNPdistance矩阵,输入文件可以是蛋白比对文件,也可以是DNA比对文件,fasta格式即可。
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利用比对文件,计算两两序列之间的SNP,最终获得SNP distance 矩阵

可以是蛋白比对文件,也可以是DNA比对文件,fasta格式即可。

示例如下:

输入文件:为核酸序列的多序列比对文件


输出结果:tab键分割的距离矩阵,第一行和第一列均为样本名称,行与列交叉处的数字表示两个样本间差异的SNP数目


此版本是1.0,上架时间是20250612