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MaAsLin 2 是一个全面的 R 语言软件包，用于高效地确定表型、环境、暴露、协变量和微生物组元组学特征之间的多变量关联。MaAsLin 2 依赖于一般线性模型来适应大多数现代流行病学研究设计，包括横断面和纵向研究，以及多种数据探索、标准化和转换方法。
示例文件：
元数据文件（tsv/txt/csv），样本为行，变量为列（分组，处理等），每个变量要求只有两个类别，如：实验组；对照组
样本中的微生物特征丰度(例如，分类单元、基因、转录本或代谢物)，以计数或者相对丰度表示（tsv/txt/csv）
小工具结果：
significant_results.tsv：重要关联的列表
metadata：与微生物特征相关联的变量名；feature：微生物特征（分类群、基因、途径等）；value：对于分类特征，这是报告系数和关联显著性的具体特征水平；coef：模型系数值（效应大小）。对于分类变量，系数表示在value中指定的类别与参考类别之间的对比；stderr：模型的标准误差；N：用于此关联的模型中样本的总数（例如，因为可以排除缺失值）；N.not.0：在这些样本中，特征非零的总数；pval：此关联的名义显著性；qval：使用p.adjust函数和校正方法（如BH等）计算得到的校正显著性。可视化图表:
heatmap.pdf
此文件包含重要关联的热图。
[a-z/0-9]+.pdf
将为每个显著关联生成一个图。
散点图用于连续元数据。
箱形图用于分类数据。
绘制的数据点是在规范化、筛选和转换之后绘制的。
软件版本：
Maaslin2 (version 1.18.0)
当前版本为1.0版本，上架时间为：2025-07-01