处理和分析微生物数据,采用随机森林分析方法进行特征选择和差异分析。
使用场景
比较不同组别之间微生物组成差异
筛选出具有统计学差异的生物标识(Biomarker )
* 若每个分组生物学重复数量小于5,此方法筛选出的结果仅供参考
* 样本数目过少可能会影响模型的稳定性,此时结果可能输出不完整
输入文件:
分组信息,第一列为样本ID,第二列为分组(Group),确保列名与示例相一致,支持 .tsv、.txt 和 .csv 格式的表格文件
OTU/特征表,每一列代表一个样本,每一行代表一个特征,支持 .tsv、.txt 和 .csv 格式的表格文件
OTU/ASV/基因注释文件 (从此处注释文件中选择分析所用分类水平,如:Phylum,Genus)
小工具结果:
*_重要变量差异检验.csv
Comparison:比较组组合;Taxa:微生物分类信息;Method:统计检验方法;Group:显著富集的组别(该组在比较中丰度更高);P.unadj:未校正的原始 p 值
*_rf_重要变量差异检验柱形图.png&pdf
*_rf_重要变量.png&pdf
当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-05-13