BLAST比对分析（自建数据库）

 本工具用于自动化 BLAST 序列比对，能够根据用户提供的查询序列和参考序列（ FASTA 文件）进行多序列比对，并将比对结果以表格形式输出。

文件名中禁止出现空格，若文件名中包含空格，可将空格修改为“_”，如：EC Strain1.fasta ，可将其修改为 EC_Strain1.fasta

• 查询序列（Query Sequence）：查询序列是用户输入的待分析的序列，通常是DNA、RNA或蛋白质序列。用户希望通过BLAST工具将这个序列与数据库中的其他序列进行比对，以寻找相似的序列或推断其功能、进化关系等，查询序列可以是单条序列（如一段基因、一个蛋白质序列）或多条序列（批量查询）。

• 参考序列（Reference Sequence，用于建库）：参考序列是用于构建BLAST数据库的已知序列集合。这些序列通常来自公共数据库（如NCBI的GenBank、UniProt等）或用户自定义的序列集，BLAST会将查询序列与这些参考序列进行比对。

本工具支持以下功能模块：

• "blastn:核酸-核酸"：BLASTN是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。
• "blastx:核酸-蛋白"：BLASTX是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列（一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白），再对每一条作一对一的蛋白序列比对。
• "tblastn:蛋白-核酸"：TBLASTN是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTX相反，它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列，再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。
• "blastp:蛋白-蛋白"：BLASTP是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。

小工具结果：

总共对应12列结果，每一列的含义如下：

query id：查询序列ID标识；refer id：参考序列ID标识；identity (%)：序列比对的一致性百分比；alignment length：符合比对的比对区域的长度；mismatches：比对区域的错配数；gap openings：比对区域的gap数目；q.start：比对区域在查询序列上(query id)的起始位点；q.end：比对区域在查询序列上(query id)的终止位点；s.start：比对区域在参考序列上(refer id)的起始位点；s.end：比对区域在参考序列上(refer id)的终止位点；e-value：比对结果的期望值，将比对序列随机打乱重新组合，与数据库进行比对，如果功能越保守，则该值越低；bit score：比对结果的bit score值。

当前版本为1.0版本，上架时间为：2025-04-29

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