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多样性代表序列进化树构建

本工具用于基于多样性(16S/ITS)研究获取代表序列进行进化树构建,生成的无根进化树可用于α和β多样性分析时计算基于系统发育关系的指标,如:计算​​UniFrac距离​​(包括加权和非加权)
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本工具用于基于多样性(16S/ITS)研究获取代表序列进行进化树构建,生成的无根进化树可用于α和β多样性分析时计算基于系统发育关系的指标,如:计算UniFrac距离(包括加权和非加权)


输入文件:

多样性(16S/ITS)研究获取代表序列(FASTA格式)


小工具结果:

unrooted-tree.nwk:无根树,没有定义的根节点,只展示序列之间的拓扑分支结构和相对距离,用于计算UniFrac距离(包括加权和非加权),这是β多样性分析的基础。

rooted-tree.nwk:有根树,包含一个根节点,该节点代表了所有序列的最近共同祖先,有根树是从无根树派生出来的可视化辅助工具,通常用无根树进行计算分析,用有根树进行可视化展示。

aligned-dna-sequences.fasta:代表序列对齐结果。


软件版本:q2cli version 2024.2.0

此版本为1.0,上架时间为2025-09-03