T3SS效应蛋白预测（EffectiveT3）

本工具用于基于提交的FASTA格式的基因组组装结果，氨基酸序列文件或包含序列信息的GBK格式文件进行III 型分泌系统预测。

III 型分泌系统 (Type III secretion system，T3SS) 主要是革兰氏阴性菌的分泌蛋白分泌到细胞外的运输途径，T3SS效应蛋白 (Type III secretion system Effector protein) 与革兰氏阴性致病菌致病机理有关。

通常用软件EffectiveT3 预测T3SS，通过其内部特定的计算模型对每条氨基酸序列进行评分，分值越高，可信度越高，选出评分高于阈值的序列，认为这些序列为III 型分泌系统效应蛋白。

输入文件：

FASTA格式的基因组组装结果，氨基酸序列文件或包含序列信息的GBK格式文件

小工具结果：

结果包含了输入文件中所有的查询序列IDs，根据得分进行排序。一共包含4列，第一列为序列ID，第二列为序列描述，第三列为预测得分，第四列描述该序列是否为效应因子。

软件版本：EffectiveT3 Version 2.0

参考文献：

Eichinger V, Nussbaumer T, Platzer A, Jehl MA, Arnold R, Rattei T. EffectiveDB--updates and novel features for a better annotation of bacterial secreted proteins and Type III, IV, VI secretion systems. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D669-74. doi: 10.1093/nar/gkv1269. Epub 2015 Nov 20. PMID: 26590402; PMCID: PMC4702896.

当前版本为1.0版本，上架时间为：2025-08-19

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