本工具基于 MINTyper 进行细菌SNP 距离矩阵和系统发育树构建，输入文件为二代/三代测序原始数据
mintyper专为疫情爆发检测中的 SNP 分型设计，特点包括：
精准聚类高同源性的细菌分离株
支持高噪声长读长数据（如 Nanopore）
基于 SNP 距离矩阵实现快速分析
输入数据：
至少指定一种测序平台数据：
--illumina [R1.fq R2.fq]Illumina 双端测序文件（必须成对提供）
--nanopore [FASTQ]Nanopore 长读长数据
--iontorrent [FASTQ]IonTorrent 数据
注：每个平台支持输入多个文件
小工具结果：
输出包括松散 phylip 格式的距离矩阵 （distmatrix.phy）、所有分析读数的组合 VCF 文件 （Combined.vcf.gz）、生成的系统发育树的 newick 文件 （outtree.newick）、一个集群文件。此外，还会创建一个包含共有序列、单个 VCF 和比对文件的数据文件夹。
软件版本：mintyper 1.1.2
当前版本为1.0版本，上架时间为：2025-08-08
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