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FAPROTAX预测微生物群落功能

本工具用于基于FAPROTAX数据库进行16S结果的微生物群落功能注释预测FAPROTAX较适用于对环境样本(如海洋、湖泊等)的生物地球化学循环过程(特别是碳、氢、氮、磷、硫等元素循环)进行功能注释预测。因其基于已发表验证的可培养菌文献,其预测准确度较好,但相比于PICRUSt和Tax4Fun来说预测的覆盖度可能会降低。输入文件:O
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工具用于基于FAPROTAX数据库进行16S结果的微生物群落功能注释预测

FAPROTAX较适用于对环境样本(如海洋、湖泊等)的生物地球化学循环过程(特别是碳、氢、氮、磷、硫等元素循环)进行功能注释预测。因其基于已发表验证的可培养菌文献,其预测准确度较好,但相比于PICRUSt和Tax4Fun来说预测的覆盖度可能会降低


输入文件:

OTU/ASV丰度信息,每行代表不同OTU/ASV,每列代表不同样本

OTU/ASV物种分类注释


小工具结果:

res_spe_func_perc.csv:预测的功能列表在各样本中的分布


FAPROTAX.png&pdf





当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-08-07