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基因组位点测序深度评估

本工具用于评估基因组中各个位点的测序深度,需提供基因组组装结果(FASTA)和质控后的双端测序原始数据(fastq)
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基因组评估
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本工具用于评估基因组中各个位点的测序深度,需提供基因组组装结果(FASTA)质控后的双端测序原始数据(fastq)


输入文件:

待评估基因组(fasta)和质控后双端测序结果


小工具结果:

    *.mean.depth.txt:FASTA文件中每一条序列平均测序深度,包含两列内容,分别为:序列ID和平均测序深度

    *.depth.txt:FASTA文件中每一条序列各个位点测序深度,包含三列内容,分别为:序列ID,序列位点和测序深度(包含所有序列,单条序列位点测序深度信息见  depth_for_single_sequence )


当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-08-04