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MetaMLST从宏基因组数据中进行多位点序列分型(双端测序/单样本)

MetaMLST是一种用于从宏基因组数据中进行多位点序列分型(MultilocusSequenceTyping,MLST)的工具。MLST是一种常用的细菌分型方法,通过比较多个保守的看家基因(housekeepinggenes)的序列,来鉴定细菌的序列型(SequenceType,ST)。MetaMLST允许直接从宏基因组数据中进行MLST分析,无需事先分离和培养细菌。输入文件:质控后的双端
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MetaMLST是一种用于从宏基因组数据中进行多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing, MLST)的工具。MLST是一种常用的细菌分型方法,通过比较多个保守的看家基因(housekeeping genes)的序列,来鉴定细菌的序列型(Sequence Type, ST)。MetaMLST允许直接从宏基因组数据中进行MLST分析,无需事先分离和培养细菌。

输入文件:

质控后的双端测序结果


小工具结果:

*_report.txt:分析结果汇总

*_ST.txt:菌株ST表


参考文献:

当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-07-08

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