MetaMLST是一种用于从宏基因组数据中进行多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing, MLST)的工具。MLST是一种常用的细菌分型方法,通过比较多个保守的看家基因(housekeeping genes)的序列,来鉴定细菌的序列型(Sequence Type, ST)。MetaMLST允许直接从宏基因组数据中进行MLST分析,无需事先分离和培养细菌。
输入文件：
单端测序质控后fastq文件
小工具结果：
*_report.txt：分析结果汇总
*_ST.txt：菌株ST表
参考文献：