MetaMLST从宏基因组数据中进行多位点序列分型（多样本批量检测）

MetaMLST是一种用于从宏基因组数据中进行多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing, MLST)的工具。MLST是一种常用的细菌分型方法,通过比较多个保守的看家基因(housekeeping genes)的序列,来鉴定细菌的序列型(Sequence Type, ST)。MetaMLST允许直接从宏基因组数据中进行MLST分析,无需事先分离和培养细菌。

输入文件：

1. list.txt：制表符分隔文件，包含2/3列内容，即样本名、第一条和第二条测序fastq文件名

2. list.txt 中所包含 fastq 文件

将上述文件保存到一个文件夹中将其压缩为zip格式文件上传

小工具结果：

*_report.txt：分析结果汇总

*_ST.txt：菌株ST表

参考文献：

• Moreno Zolfo, Adrian Tett, Olivier Jousson, Claudio Donati and Nicola Segata - MetaMLST: multi-locus strain-level bacterial typing from metagenomic samples - Nucleic Acids Research, 2016 DOI: 10.1093/nar/gkw837

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