示例文件:
分组信息文件,至少需要包含指定列,Env(处理或分组),SourceSink(source/sink),支持 .tsv、.txt 和 .csv 格式的表格文件
OTU/ASV/基因丰度信息文件,支持 .tsv、.txt 和 .csv 格式的表格文件
小工具结果:
source/sink_SourceTracker.pdf&png:不同颜色代表不同的微生物来源,图中的比例表示各来源在预测样本中的组成比例,未知来源标记为 "Unknown"。
软件版本:
SourceTracker(Version 1.0)
参考文献:
1. Knights D, Kuczynski J, Charlson ES, et al. Bayesian community-wide culture-independent microbial source tracking [J]. Nature Methods, 2011, 8(9): 761.
2. Dominguez-Bello MG, De JKM, Nan S, et al. Partial restoration of the microbiota of cesarean-born infants via vaginal microbial transfer [J]. Nature Medicine, 2016, 22(3): 250-253.
当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-07-01