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Phatyp 噬菌体生活方式的预测

PhaTYP是一种基于BERT(BERT-based)的模型,它从噬菌体基因组中学习蛋白质组成与关联,以分类噬菌体的生活方式。溶源性噬菌体和裂解性噬菌体是噬菌体的两种类型。输入文件为待注释contig文件,后缀名为*.fasta、*.fa、*.fas、*.fna、*.fnn等,提交文件后设置长度截止阈值,要求>=3000bp,如:3000
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PhaTYP是一种基于BERT(BERT-based)的模型,它从噬菌体基因组中学习蛋白质组成与关联,以分类噬菌体的生活方式。溶源性噬菌体和裂解性噬菌体是噬菌体的两种类型。溶源性噬菌体会在感染细胞后逐渐地释放新生噬菌体,最终溶解宿主细胞并释放大量的新噬菌体。而裂解性噬菌体则在感染一定数量的宿主细胞后突然裂解并释放新噬菌体。


示例文件:

待注释contig文件,后缀名为*.fasta、*.fa、*.fas、*.fna、*.fnn等,提交文件后设置长度截止阈值,要求>=3000bp,如:3000



小工具结果:

phatyp_prediction.tsv

当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-07-06

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