收藏小工具

Phagcn噬菌体分类注释

PhaGCN是一个基于GCN的模型,它可以通过深度学习分类器学习物种掩蔽特征,用于新的病毒分类注释。输入文件为待注释contig文件,后缀名为*.fasta、*.fa、*.fas、*.fna、*.fnn等,提交文件后设置长度截止阈值,要求>=3000bp,如:3000
本流程已累计运行42次。
基因组与功能注释
请选择计算文件

运行状态

计算结果

下载计算结果

PhaGCN 是一个基于 GCN 的模型,它可以通过深度学习分类器学习物种掩蔽特征,用于新的病毒分类注释。


示例文件:

待注释contig文件,后缀名为*.fasta、*.fa、*.fas、*.fna、*.fnn等,提交文件后设置长度截止阈值,要求>=3000bp,如:3000



小工具结果:

phagcn_prediction.tsv

Accession:序列标识符;Length:序列长度(bp);Lineage病毒分类谱系,病毒在 ICTV(国际病毒分类委员会)分类系统中的具体位置;PhaGCNScore:分类置信度分数;Genus:属名,如果无法分类到属级别,则显示 -;GenusCluster:属级聚类状态,known_genus(该病毒与数据库中的已知属聚类,属于已知病毒)/singleton(未与任何已知属聚类,可能代表一个新的属)Prokaryotic virus:是否为原核病毒,Y(是原核病毒,噬菌体或古菌病毒)/N(不是原核病毒,可能是真核病毒,如感染人类、动物或植物的病毒)

当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-07-06