基于多序列比对结果分析SNP/Indel

此工具基于多序列比对结果分析SNP/Inel。默认将第一条序列序列作为参考序列，分析其他序列相对于参考的SNP/Indel。

示例

输入数据：核酸多序列比对文件

输出结果：

会生成两个结果文件，snp.xls和indel.xls。都是默认以第一条序列为参考序列，计算其他样本相对于参考的SNP和indel。

1、indel.xls——分别以第一条序列为参考计算其他样本相对参考样本的indel，如Seq1_vs_Seq2即为seq2相对seq1的indel结果，第一列为Id，第二列“Pos（in ref）”即在参考序列中的位置，第三列“Ref”在参考序列中的碱基，第四列“Pos”在分析样本中的位置，第五列“Alt”在待分析样本中的碱基。

2、snp.xls——分别以第一条序列为参考计算其他样本相对参考样本的indel，如Seq1_vs_Seq2即为seq2相对seq1的SNP结果，第一列为ID，第二列“Pos（in ref）”即在参考序列中的位置，第三列“Ref”在参考序列中的碱基，第四列“Pos”在分析样本中的位置，第五列“Alt”在待分析样本中的碱基，即突变之后的碱基。

此版本为1.0，上架时间为20250619。

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