基于平均核苷酸同一性的微生物基因组分类工具 (pyani)

基于平均核苷酸同一性的微生物基因组分类工具 (pyani)

1. #亲缘关系较近的菌株计算ANI使用ANIm法，较远使用ANIb法

2. #ANIm: uses MUMmer (NUCmer) to align the input sequences

3. #ANIb: uses BLASTN+ to align 1020nt fragments of the input sequences

4. #ANIblastall: uses legacy BLASTN to align 10al20nt fragments of the input sequences

5. #TETRA: calculates tetranucleotide frequencies of each input sequence

当前版本为1.0版本，上架时间为：2025-06-03

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