MLST(Multi-Locus Sequence Typing)是一种基于核酸序列的细菌分型技术,主要用于微生物种群中菌株的分型鉴定。MLST通过细菌内保守但具有足够多态性的基因座(loci)(通常是6到10个)的核苷酸序列来区分不同的菌株。本工具用于单个基因组的MLST分型。输入文件为单个菌株全基因组组装结果,后缀名为*.fasta、*.fa、*.fas、*.fna、*.fnn等。
示例文件:
单个菌株全基因组组装结果,后缀名为*.fasta、*.fa、*.fas、*.fna、*.fnn等,并设置菌株名称(避免名称中出现空格)
小工具结果:
DS1 | ecoli_achtman_4 | 7060 | adk(6) | fumC(4) | gyrB(5) | icd(16) | mdh(24) | purA(1) | recA(14) |
当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-05-27