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MLST分析(单个基因组注释)

MLST(Multi-Locus Sequence Typing)是一种基于核酸序列的细菌分型技术,主要用于微生物种群中菌株的分型鉴定。MLST通过细菌内保守但具有足够多态性的基因座(loci)(通常是6到10个)的核苷酸序列来区分不同的菌株。本工具用于单个基因组的MLST分型。输入文件为全基因组组装结果,后缀名为*.fasta、*.fa、*.fas、*.fna、*.fnn等。
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基因组与功能注释
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MLST(Multi-Locus Sequence Typing)是一种基于核酸序列的细菌分型技术,主要用于微生物种群中菌株的分型鉴定。MLST通过细菌内保守但具有足够多态性的基因座(loci)(通常是6到10个)的核苷酸序列来区分不同的菌株。本工具用于单个基因组的MLST分型。输入文件为单个菌株全基因组组装结果,后缀名为*.fasta、*.fa、*.fas、*.fna、*.fnn等。


示例文件:

单个菌株全基因组组装结果,后缀名为*.fasta、*.fa、*.fas、*.fna、*.fnn等,并设置菌株名称(避免名称中出现空格)



小工具结果:

DS1 ecoli_achtman_4 7060 adk(6) fumC(4) gyrB(5) icd(16) mdh(24) purA(1) recA(14)


当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-05-27