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序列的四核苷酸频率计算

本工具可以对提供的FastA序列进行四核苷酸频率特征计算
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四核苷酸(4-mer)是DNA或RNA中连续四个核苷酸的组合,其频率或分布特征在生物信息学中具有多重应用价值:

系统发育分析:通过比较不同物种或菌株的四核苷酸频率差异,可构建高分辨率的系统发育树,区分高度相似的近缘物种(如大肠杆菌与志贺氏菌)。
相比传统16S rRNA基因分析,四核苷酸频率能捕捉更细微的进化信号,减少水平基因转移的干扰。
基因功能与调控预测:四核苷酸模式可能关联启动子、增强子等调控元件的特征(如TATA框的保守序列)。
在RNA中,四核苷酸环(如UNCG、GNRA家族)影响RNA二级结构的稳定性和与蛋白质的相互作用。
表观遗传学与甲基化分析:四核苷酸序列的甲基化位点分布(如CpG岛)可作为表观遗传标记,用于疾病关联研究。

本工具可以对FastA序列格式文件进行四核苷酸分析,需提供后缀名是*.fna、*.fasta、*.fnn、*.fa、*.fas等格式的FASTA格式文件。

当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-05-27