Prokka原核基因组注释

Prokka原核基因组注释，输入文件为FASTA格式的基因组预组装基因组DNA序列

输入文件：

FASTA格式的基因组预组装基因组DNA序列

小工具结果：

*.faa：预测的所有编码序列（CDS）的蛋白质翻译产物序列文件（FASTA format of amino acids）
*.ffn： 预测的所有编码基因（CDS）的核苷酸序列文件（FASTA format of nucleotides）
*.fna：输入的基因组序列文件（FASTA format）
*.fsa：包含源序列的FASTA文件
*.gbk：GenBank 格式的文件。包含完整的注释信息以及原始基因组序列本身
*.gff：采用 GFF3 (General Feature Format version 3) 格式，包含基因组上所有预测的基因、RNA 特征（tRNA, rRNA, ncRNA等）、CDS（编码序列）以及它们的位置、功能注释（如基因名称、产物描述）、EC号（如果可预测）、注释来源等信息
*.sqn：提交到 GenBank 所需的 ASN.1 格式文件
*.tbl：Sequin 表格格式文件
*.tsv：表格格式（Tab-Separated Values）的注释摘要。包含特征（Feature）ID、类型、位置、长度、基因名称、基因座标签、产物描述、EC号等字段
*.txt：摘要统计文件，包含一些基本的统计信息

软件版本：Prokka 1.14.6

参考文献：

Seemann T. Prokka: rapid prokaryotic genome annotation. Bioinformatics. 2014 Jul 15;30(14):2068-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btu153. Epub 2014 Mar 18. PMID: 24642063.

当前版本为1.0版本，上架时间为：2025-05-21

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