Species Accumulation Curves(物种积累曲线):生态学中常用的一种方法,用于描述随着样本数增加,发现的物种数量(或 OTUs, 操作分类单元)的增长情况。它们在微生物、植物、动物等生物群落研究中都非常有用,用于评估物种的丰富度和样本的代表性。
曲线特征:
初始上升期:在采样初期,随着样本数量的增加,累积物种数量会迅速增加。这是因为每增加一个样本,往往会带来许多新物种。
减速阶段:随着采样数增加,曲线增长速度减缓,意味着大部分物种已经被检测到,后续采样发现的新物种数量减少。
平台期:最终,曲线会趋于平缓,进入所谓的平台期。此时,继续增加采样不太可能显著增加物种数量,说明样本中大多数物种已经被发现。
输入文件:
OTU/特征表,每一列代表一个样本,每一行代表一个特征,支持 .tsv、.txt 和 .csv 格式的表格文件
小工具结果:
Species_accumulation_curves.png&pdf
陡峭的曲线:表明新物种随着每个样本快速累积,代表着群落的物种多样性较高。
平缓的曲线:意味着在增加样本时,新物种累积的速度减缓,表明大多数物种已经被采集到。
当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-05-13