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微生物α多样性分析

对微生物组数据进行α多样性分析,计算样本的α多样性指数,并使用箱线图对结果进行可视化。使用场景衡量单个样本内微生物群落的复杂性、丰富度和均匀度比较不同组别样本间的α多样性差异是否显著,从而验证实验分组或处理是否有效筛选离群值,即多样性指数的值偏离同一组别其他样本的样本
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对微生物组数据进行α多样性分析,计算样本的α多样性指数,并使用箱线图对结果进行可视化。


使用场景

衡量单个样本内微生物群落的复杂性、丰富度和均匀度

比较不同组别样本间的α多样性差异是否显著,从而验证实验分组或处理是否有效

筛选离群值,即多样性指数的值偏离同一组别其他样本的样本


输入文件:

分组信息,第一列为样本ID,第二列为分组(Group),确保列名与示例相一致,支持 .tsv、.txt 和 .csv 格式的表格文件

OTU/特征表,每一列代表一个样本,每一行代表一个特征,支持 .tsv、.txt 和 .csv 格式的表格文件


小工具结果:

alpha_diversity.csv:α多样性指数表

dif_alpha.csv:不同组别间多样性指数差异检验结果,当参数“是否进行p值矫正值为false时,P.adj列显示的为未校验的p值”


*_alpha.png&pdf

当前版本为1.0版本,上架时间为:2025-05-13