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本工具用于从宏基因组数据中挖掘抗菌肽（Antimicrobial Peptides，AMPs）。输入文件为宏基因组的组装结果Fasta格式文件，或预测的蛋白序列文件。
示例文件：
宏基因组的组装结果，选择：contigs
预测的蛋白序列文件，选择：peptides
小工具结果：
macrel.out.prediction
Access：序列标识符；Sequence：预测的氨基酸序列；AMP_family：AMP 家族分类，A/C：阴离子/阳离子肽， D/L：含半胱氨酸/线性肽， 后缀 P表示肽段（例：阳离子含半胱氨酸肽 → CDP）；AMP_probability：该序列为抗菌肽的概率（0-1）；Hemolytic：溶血性分类，Hemo（溶血性）/NonHemo（非溶血性）；Hemolytic_probability：溶血活性的概率（0-1）。
macrel.out.all_orfs.faa：全部预测的开放阅读框（ORFs）
macrel.out.smorfs.faa：预测的小型 ORFs（smORFs），长度范围限定为 10-100 个氨基酸。
macrel.out.percontigs：每个 contig 的统计摘要
列名 | 说明 |
|---|---|
| Contig 标识符（与输入 FASTA 一致； |
| Contig 长度（单位：bp） |
| 预测的 ORF 总数 |
| 预测的小型 ORF（smORF）数量 |
| 预测为抗菌肽（AMP）的序列数量 |
软件版本：
macrel v1.5.0
参考文献：
Santos-Júnior CD, Pan S, Zhao X, Coelho LP. 2020. Macrel: antimicrobial peptide screening in genomes and metagenomes. PeerJ 8:e10555. DOI: 10.7717/peerj.10555
当前版本为1.0版本，上架时间为：2025-06-13